インターネット上で名誉毀損となる投稿がなされた場合、一般的には、サイトの運営者に対し投稿者のＩＰアドレス等の開示を求め、その開示を受けた後、ＩＰアドレス等から把握できる「投稿者が契約しているプロバイダ（経由プロバイダ）」に対し、投稿者の住所氏名等の開示を求めるという方法を取るべきものとされています。
これは、いわゆるプロバイダ責任制限法に基づく手続なのですが、実際には、サイトの運営者が任意にＩＰアドレス等の開示請求に応じないことも多く、その場合には、裁判所に対し、その運営者を相手方として、ＩＰアドレス等の開示を求める申立を行い、その命令をもとに強制的に開示させる以外には、手段がないと思われます。
ただ、その場合には、サイトの運営主体をどのように把握するか、その住所等（申立書の送達先）をどのように調査するか、管轄等はどうなるか、仮処分命令がなされたとして、運営者が現実に従うのか（従わないとして、強制的に開示させるには、どのような方法を講じることができるのか）といったハードルがあり、この制度も、決して万能ではありません。
そして、私の知る限り、この点が顕著な壁となって生じるのが、インターネット掲示板「２ちゃんねる」ではないかと思います。
５年以上前のことですが、２ちゃんねる上に名誉毀損の投稿をされたという方から、投稿者を特定して責任を問いたいという趣旨のご相談を受けたことがあります。それまで、この種の問題を扱ったことはありませんでしたが、当時、２ちゃんねるの投稿被害が社会的にも多いに問題となっており、盛岡に、その問題を専門的に扱う方がいるという話も聞いたことがありませんでしたので、お役に立てればとの思いで調査等をお引き受けして色々と調べるなどしたのですが、結局、上記の壁（ちょうど、２ちゃんねるの運営が創業者の西村氏からシンガポール国籍の会社に譲渡されたなどという報道が飛び交っている時期で、その点でも幾つかのハードルがありました）にぶち当たり、当方では対応困難として、お断りせざるをえませんでした。
その後、平成25年に２ちゃんねるなど各種の掲示板での名誉毀損の投稿に対する削除及び発信者情報開示請求の手続について詳細に記載した書籍が出版されており（中澤佑一「インターネットにおける誹謗中傷法的対策マニュアル」）、同書には、平成25年当時における２ちゃんねるへの発信者情報の取得のための仮処分の申立等の方法（シンガポール国籍の会社を相手方とする申立の方法や必要書類の取得方法など。なお、法務局に納付を要する供託金は30万円とされています）及び仮処分命令に基づく２ちゃんねるのサイトへの発信者情報の開示請求の手続などについて、詳細に説明がなされています。
ただ、さきほど、２ちゃんねるのサイトを確認したところ、現在、同サイトの管理会社として、上記会社とは別の会社（ネット情報では、フィリピン国籍と表示しているものもあります）が表示されており、現在も、２ちゃんねる絡みの投稿問題で発信者情報の開示請求を行う場合には、当事者の特定や所在などで厄介な論点が存するため、上記の問題を取り扱って成果をあげた、限られた弁護士でないと対応が困難ではないかと思われます。
私に関しては、その後に２ちゃんねるの投稿問題に関しご相談を受ける機会はなく、社会的にも、２ちゃんねるに関しては、当時に比べれば沈静化した面はあるのではないかと思っていますが、違法行為（名誉毀損投稿）の温床になっている社会的存在（２ちゃんねる）が、当事者の特定や所在などという、法的責任を問うための事実調査のレベルで大きな困難を伴い、結果として権利保護（被害者から投稿者＝加害者への責任追及）が困難になるというのは望ましくないことは明白で、上記の壁をクリアできるような、何らかの立法的解決を要するのではないかと思います。
例えば、名誉毀損投稿が頻発しているようなサイトについては、消費者庁が指定して、サイトの運営者は被害者から削除や発信者情報開示の請求がなされた場合には直ちにこれに応じることができるシステムを構築しなければならない（その認証等を受けなければ、サイトの閉鎖命令に応じなければならない）とするような特例法を考えてもよいのではないかと思っています。